Es gibt zahlreiche pilzliche Krankheiten, die den Tabak sowohl auf dem Feld als auch im Trockenschuppen befallen. Die bedeutendste Pilzkrankheit im Tabakanbau ist der Blauschimmel (Peronospora tabacina), der praktisch in allen Tabakanbaugebieten große Schäden verursacht.
Es handelt sich dabei um eine Bakterienkrankheit, die besonders in den südlichen Bundesstaaten der USA vorkommt und dort die Reben innerhalb von ein bis zwei Jahren zum Absterben bringt.
Alle BYD-Viren verursachen Verzwergungen der Pflanzen. Symptome zeigen sich bereits bei frühzeitig gesäter Wintergerste im Herbst, der volle Umfang des Befalls wird allerdings erst im Frühjahr sichtbar.