Eine Vielzahl von Krankheiten kann die Zuckerrübe befallen. Pilzliche Erreger befallen vor allem die Keimpflanzen (Wurzelbrand-Komplex) und im weiteren Vegetationsverlauf den Blattapparat (u.a. Cercospora- und Ramularia-Blattflecken).
Im Zuckerrübenanbau gibt es relativ wenige bedeutende Bakterienkrankheiten. Die einzige bakterielle Blattfleckenkrankheit der Zuckerrübe, die unter mitteleuropäischen Anbaubedingungen auftritt, wird durch Pseudomonas syringae pv. aptata verursacht. Weitere Bakteriosen, wie der Wurzelkropf (Agrobacterium tumefaciens) und der Rübenschorf (Streptomyces scabies), rufen keine wirtschaftlichen Schäden hervor und sind von untergeordneter Bedeutung.
Bedeutsame Viren, die den Zuckerrübenanbau erheblich erschweren und beeinträchtigen sind das Nekrotische Rübenvergilbungs-Virus (BYV), Westliches Rübenvergilbungs-Virus (BWGV), Rhizomania-Wurzelbärtigkeit (BNYW), Rübenmosaik-Virus (BtMV) und das Rübenkräusel-Virus (BLCV).
